Protein mühendisliği moleküler biyoloji ve genetik alanındaki çalışmaların bir sonraki aşaması olarak ortaya çıkan disiplinler arası yeni bir alandır. Protein mühendisliğinin amacı temel mühendislik prensiplerini, genetik ve kimyasal teknikleri kullanarak istenen özelliklerle donatılmış yeni moleküller üretmektir. Protein mühendisliği yeni ilaçların keşfedilmesi, endüstride kimyasalların üretimi, transgenik bitki araştırmaları, ve nanoteknoloji gibi alanlarda uygulanmaktadır. Yard. Doç. Dr. Başak Sürmeli, metalloproteinler ile ilaç ve değerli kimyasalların üretiminde kullanılmak üzere yeni biyokatalizörlerin tasarımı üzerine çalışmaktadır.